В православной гимназии сложились свои традиции и формы воспитательной работы, которые соответствуют новым стандартам образования Российской Федерации и стандарту православного компонента начального общего, основного общего, среднего (полного) общего образования.
В гимназии функционирует модель «Школа полного дня», в рамках которой широко представлена система внеурочной деятельности и дополнительного образования. Ежегодно действует благотворительный отряд «Радуга», Хор православной гимназии, изостудия «Истоки», студия иконописи, ансамбль танца «Святоч», театральная студия «Пилигрим», а также патриотический клуб «Илия Муромец», кружки спортивной и технической направленности. Для гимназистов предусмотрены дополнительные индивидуальные занятия в «Школе одаренного ребенка», факультативы и элективные курсы.
В течение учебного года гимназическая жизнь разнообразна и включает в себя праздники, тематические недели и классные часы, экскурсионно-паломнические поездки, выставки, спортивно – оздоровительные мероприятия, которые делают воспитательную работу интересной и содержательной.
Доброй традицией в округе Муром стали Окружной конкурс юных чтецов «Свет Рождественской звезды» и Окружной конкурс детского декоративно – прикладного творчества «Пасхальная радость», которые для учащихся общеобразовательных организаций нашего города и Муромской епархии проходят на базе гимназии.
Созданная в Православной гимназии система работы построена на принципах сохранения и развития традиций учебной и внеурочной деятельности и представляет собой сложный, хорошо организованный механизм, позволяющий сосредотачиваться на сердце воспитанников, ибо, по словам святителя Иоанна Кронштадтского, «ум видит то, что прежде видит сердце».